Puskesmas Balinggi didirikan pada tahun 2003 pecahan dari Puskesmas sausu yang merupakan bangunan Pustu yang di tingkatkan statusnya menjadi Puskesmas. Pada saat itu wilayah kerja Pukesmas Balinggi terdiri dari 2 Desa ( Desa Balinggi dan Desa Malakosa dengan status pukesmas rawat jalan kategori Puskesmas Terpencil. Puskesmas Balinggi berada di Desa Balinggi Jati, Kec. Balinggi, Kabupaten Parigi Moutong, Sulawesi Tengah.
Puskesmas Balinggi di pimpin Bapak I Made Mustika Diarta, SKM selaku Kepala Puskesmas. Dalam rangka mengemban tugas pelayanan menyeluruh dan terpadu kepada masyarakat mencakup usaha peningkatan kesehatan promotif, preventif, kuratif dan rehabilitatif yang semuanya bertujuan untuk meningkatkan derajat kesehatan yang optimal sebagai salah satu unsur dari kesejahteraan masyarakat umum.
Dengan segala keterbatasan sarana dan prasarana yang ada, Puskesmas berusaha memberikan pelayanan kesehatan yang terbaik kepada masyarakat, pada bulan april tahun 2018 di laksanakan penilaian Akreditas untuk memenuhi kebutuhan elemen penilain sesuai Permenkes 75 khususnya dibidang sarana pelayanan yang belum memenuhi persyaratan dilihat dari ruangan yang ada, tetapi Puskesmas Balinggi tetap berusaha untuk memaksimalkan yang ada dengan membuat sekat pada rangan, sehingga akhirnya memperoleh predikat madya. Setelah penilaian akreditas, Puskesmas Balinggi terpilih sebagai wakil Kabupaten Parigi Moutong dan provinsi Sulawesi Tengah dalam penilaian pukesmas berprestasi tingkat Nasional kategori puskesmas daerah terpencil pada bulan september 2018 dan meraih juara 3 di tingkat Nasional, Prestasi-prestasi ini bisa di raih berkat semangat, kekompakan, kerja keras dan kerjasama baik staf puskesmas maupun kerjasama lintas sektor terkait.
Walaupun sudah masuk sebagai Puskesmas berprestasi ditingkat Nasional, namun masih banyak kekurangan yang perlu tingkatkan. Pada saat melaksanakan SMD, MMD rapat Lintas Sektor dan masukan – masukan lainya dari masyarakat, satu hal yang dapat di simpulkan bahwa masyarakat butuh pelayanan 24 jam (rawat inap). Kemudian atas dasar kebutuhan dari masyarakat kami mengusulkan bangunan Puskesmas kepemerintah daerah lewat Dinas Kesehatan Kabupaten Parigi Moutong, sehingga pada Bulan September tahun 2019 didirikan bangunan Baru.
Luas wilayah Puskesmas Balinggi adalah 223.88 Km’. Batas wilayah Puskesmas Balinggi. Adapun batas-batas wilayah sebagai berikut :
Sebelah Utara : berbatasan dengan Teluk Tomini
Sebelah Selatan : berbatasan dengan gunung
Sebelah Timur : berbatasan dengan Desa Sausu Taliabo
Sebelah Barat : berbatasan dengan desa Tolai Timur